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基因组关联分析技术应用培训班

2017-04-18 00:00:00 北京

基因组关联分析技术应用培训班

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段，其与以“求同法”思想为核心的“序列比对（Blast）”同样重要，但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部，主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员，特开设基因组关联分析培训班。

主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位：北京市计算中心

协办单位：云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

举办地点：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间：2017年4月18日-4月20日上午9：30-12：00，下午13：30-17：30

日期	授课题目	授课内容
第一天	基因组关联分析理论基础	1、基因组学与生物信息学概述； 2、基于群体遗传的数据获取； 3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍； 4、常用GWAS数据库介绍；
第一天	Plink软件基础应用	5、 Plink软件应用； 6、 Plink文件格式生成与解析； 7、等位基因频率计算； 8、哈-温平衡计算； 9、目标区域数据提取； 10、基因组关联分析流程； 11、关联分析结果分析与p校正；
第二天	基因型填充Imputation	12、基因型填充Imputation的原理及应用； 13、 Beagle软件介绍与应用； 14、基因组填充的方法与分析流程； 15、 1000G数据应用
第二天	Plink软件进阶应用	16、基于家系的关联分析； 17、曼哈顿图的绘制与结果展示； 18、 SNP位点的condition分析； 19、 Meta gwas数据分析；
第三天	Haploview软件	20、 Haploview软件应用； 21、 Haplotype单倍型分析； 22、 LD连锁不平衡指数计算； 23、 SNP marker之间的r²、D值等计算；
第三天	Tassel软件	24、 Tassel软件应用； 25、 Tassel基于命令行的批量数据分析； 26、生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等；

(课程内容以实际授课为准)

注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。

【培训特色】

无需任何计算机语言基础

深入简出，内容精要实用

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用

边学边练，重实践，力求实效

小班授课，个别辅导

【报名费用】注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称：北京市计算中心账号：0200151819100023937

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

（汇款信息里 备注上：“生物计算事业部——您的姓名”）

【报名优惠政策】
1、2017年3月15日前报名并缴费，可享受减免300元优惠；

2、3人以上团体报名每人可减少400元；

3、4+1团报，可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

【联系咨询】QQ：2814500767
于老师 010-59341771，15600660904，邮箱：yurt@bcc.ac.cn

员老师 010-59341773，18701529461, 邮箱：yuanll@bcc.ac.cn

会议日期

2017年04月18日 -04月20日