2018年 广州-蛋白质组学数据分析 学习会

一、经典蛋白质组数据的鉴定和质量控制

1、鉴定的质谱技术基本原理；

2、蛋白质组鉴定整体分析流程介绍；

3、肽段序列的质谱鉴定（包括序列库搜索、图谱库搜索、De novo）；

4、利用鉴定肽段进行蛋白质的推导（组装）；

5、肽段和蛋白质鉴定的质量控制；

6、肽段修饰的质谱鉴定和质量控制。

二、定量蛋白质组方法和应用

1、 蛋白质组有标、无标和肽段SRM绝对定量；
2、 定量结果的显著性分析；
3、 定量软件的介绍及定量方法的应用。

三、生物质谱数据库和数据提交及上机实习

1、 蛋白质组学实验数据库介绍；

2、 蛋白质组数据共享；

3、 蛋白组质数据提交。

四、蛋白质组实验数据介绍及MaxQuant上机实习

1、 蛋白质组实验数据介绍；

2、 基于MaxQuant分析一组蛋白质组实验数据。

五、蛋白质组学实验设计及蛋白质组信息学常用软件

1、利用蛋白质组学实验可以解决的科学问题；

2、蛋白质组学实验设计方案及相应分析策略；

3、蛋白质组信息学常用软件介绍及上机实习。

六、修饰蛋白质组学技术原理及应用

1、蛋白质翻译后修饰组学的基本概念、原理；

2、蛋白质翻译后修饰组学的方法、工具及注意事项。

七、多肽组学技术原理及应用

1、多肽组学基本概念；

2、多肽组学实验设计及应用示例。

八、质谱数据挖掘和蛋白质基因组学

1、 搜索数据库的选择和跨物种鉴定；
2、 质谱数据挖掘的通用方法；
3、 蛋白质基因组学。

九、蛋白质组数据注释及功能分析

1、蛋白质-基因编号mapping；

2、蛋白质表达数据的聚类分析、相关性分析；

3、富集缺失分析、GO/Pathway 功能注释；

4、染色体定位分析；

5、蛋白质互作网络分析。

十、蛋白质组数据分析常用数据库和工具

1、常用的生物信息学数据库和工具；

2、蛋白质结构和进化分析主要数据库和工具；

3、上机练习。