2015.8.2-8.5日 Perl 语言与生物信息学应用

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Perl语言基础与生物信息学应用讲习班 

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员，且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加！ 

主办单位：北京市计算中心，生物计算事业部 

举办地：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼 

培训时间：第九期2015年8月2日-5日 （报名中） 

培训内容及安排： 

日期 

时间 

授课题目 

授课内容 

第一天 

09:30-10:00

生物信息学与Perl语言概述 

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点 

10:00-10:20

软件安装与运行环境调试 

Perl语言解释器、编辑器安装，Perl程序运行测试 

10:20-12:00

基本操作与基本概念 

DOS、Unix命令行操作基本命令；Perl语言基本变量与操作符；基本变量、字符串赋值、基本运算等 

13:30-16:30

基本语法结构、文件与文件夹操作 

判断结构；循环结构；文件的读入与输出；文件夹操作 

第二天 

09:30-12:00

数组、二维数组、hash表及应用 

数组的概念及用法； 

二维数组概念与应用； 

关联数组(hash表)的用法； 

13:30-16:30

函数、子程序、正则表达式 

常用函数学习； 

子程序概念与应用； 

正则表达式的应用； 

第三天 

09:30-11:00

生物信息学Perl程序实例与应用 

常用生物信息学数据库及专业软件应用简介； 

二代测序数据分析； 

生物信息学实用程序； 

11:00-12:00

CAPN与Bioperl简介、Bioperl的安装 

Perl模块安装、包与引用简介； 

Perl第三方代码库CPAN的简介与应用； 

Bioperl简介与安装； 

13:30-16:30

Bioperl的基本应用 

文件读取与格式转换； 

生物学数据自动化批量下载； 

序列信息统计与分析 

第四天 

09:30-12:00

Bioperl应用进阶学习 

GenBank基因组文件特定信息提取； 

序列自动化比对； 

进化距离计算； 

13:30-16:00

数据可视化与做图等 

Perl语言做图； 

基因组信息图形化展示； 

Perl的外界调用与整合应用； 

Perl面向对向编程序 

（此表仅供参考，授课内容以实际授课为准） 

注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。 

【培训特色】 

1、对口生物信息； 2、非严格语法，适合初学； 

3、功能强大、跨平台；4、有巨大的第三方代码库CPAN

【报名费用】 注册费：3000元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。 

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款 

单位全称：北京市计算中心 账号：0200151819100023937 

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 

（汇款信息里 备注上：“生物计算事业部——您的姓名”） 

【报名优惠政策】 

1、2015年7月10日前报名缴费，可享受减免400元优惠 

2、3人以上团体报名每人可减少400元； 

3、4+1团报，可免费赠送一个名额 

4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。 

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。 

【联系咨询】 

张利英 010-59341771 ,18618295767，QQ号：2814500767，邮箱：zhangly@bcc.ac.cn 

员丽丽 010-59341773, 18701529461 , 邮箱：yuanll@bcc.ac.cn